| 文献精读 | 大麦颖果发育与萌发的四维空间转录组图谱 |
核心速递 : 本文通过连续切片结合时序采样，构建了首个大麦籽粒从发育到萌发全周期的高分辨率四维（3D空间+时间）表达图谱，以亚组织级分辨率揭示了代谢、能量与激素调控中极为复杂的空间异质性与斑驳分布模式。 1. 论文基本信息 Title: A four-dimensional spatial tra...
单细胞与空间组学
| 文献精读 | 空间转录组学数据的分析与可视化：从技术演进到核心算法的全景剖析 |
核心速递 : 本文系统性地梳理了空间转录组学实验技术的演进路线，并深度剖析了针对海量空间数据在表达域降维聚类、空间域挖掘、空间变异基因识别以及细胞通讯网络推断等维度的核心计算生态与底层算法逻辑。 1. 论文基本信息 Title: Analysis and visualization of spat...
| 文献精读 | 水稻8大器官单细胞多组学全景图谱与功能基因发掘 |
核心速递 : 本研究首次利用单细胞多组学技术（同时解析 RNA 与 ATAC）构建了水稻8大核心器官的高精度细胞图谱，打破了以往单模态数据的局限，通过在硅计算机拟（in silico perturbation）与共表达网络分析，成功挖掘并验证了协同碳氮代谢与根系发育的关键农艺基因，为禾本科作物的发育时空轨迹...
| 文献精读 | 连续空间转录组揭示玉米叶片发育的调控转换 |
核心速递 : 本研究深度优化了植物冷冻切片与 10x Visium 空间组学流程，首次高分辨率重构了玉米茎尖分生组织（SAM）至连续发育叶片的 3D 时空基因表达图谱，通过联合单细胞反褶积与时序网络，精准锚定了控制器官发生与细胞命运决定的转录因子级联模块。 1. 论文基本信息 Title: Ser...
| 文献精读 | 单细胞多组学图谱解锁细胞奥秘：大豆与水稻的里程碑研究 |
核心速递 : 本文深入剖析了大豆与水稻的两项里程碑式单细胞多组学研究，展示了如何通过“转录组+染色质可及性+空间组学”的多模态整合，精准破译驱动复杂农艺性状与细胞命运转化的特异性基因调控网络（GRNs）。 1. 论文基本信息 Title: Single cell multi-omics atla...
| 文献精读 | 引入单细胞时空组学测序技术（Stereo-seq）重塑植物转录组图谱 |
核心速递 : Stereo-seq 技术通过结合 DNA 纳米球（DNB）原位测序与单细胞转录组学，在无需原生质体分离的情况下，实现了纳米级分辨率的植物空间转录组分析，首次在复杂植物组织中成功解析了高度相似的细胞亚型和空间发育轨迹。 1. 论文基本信息 Title: Introducing si...
| 文献精读 | 空间与单细胞组学数据的新型整合揭示特发性肺纤维化发病机制 |
核心速递 : 本研究创新性地采用“Query”和“Overlap”纯统计学算法，跨越数据模态边界，将空间转录组/蛋白质组特征与单细胞转录组无缝对齐，精准定位了特发性肺纤维化（IPF）不同空间微环境中的驱动细胞群。 1. 论文基本信息 Title: Novel Integration of Spat...
| 文献精读 | 单细胞分辨率下的水稻根系转录全景图谱 |
核心速递 : 本研究首次构建了单子叶模式植物水稻根尖的高分辨率单细胞转录组图谱，定义了全新的细胞类型特异性 Marker 基因，并揭示了单双子叶植物在根部细胞命运决定和响应环境胁迫中的进化保守性与高度特异性分化。 1. 论文基本信息 Title: Transcriptional landscape...
| 文献精读 | 玉米茎尖分生组织花期过渡的动态及细胞类型特异性转录重编程 |
核心速递： 本研究结合时序Bulk RNA-seq、单细胞转录组（scRNA-seq）及表观遗传组学技术，首次以高时空分辨率解析了玉米茎尖分生组织在花期过渡过程中的转录重编程机制，揭示了由 ZmMADS69-ZmRap2.7-ZMM4 构成的精准调控环路及核心模块的细胞空间异质性。 1. 论文基本信息 ...
💬 分类讨论