文献精读 用离散扩散模型缩短蛋白并尽量维持功能 1 分钟阅读 核心速递: SCISOR 将蛋白缩短设计改写为“从随机插入噪声中学习删除”的离散扩散过程,使模型能在保持自然序列特征的同时规划多位点 deletion。
文献精读 宏基因组尺度解析预测蛋白结构宇宙 2 分钟阅读 核心速递: AFESM 将 AFDB 与 ESMatlas 整合为 821M 规模的预测结构资源,显示宏基因组蛋白的新颖性更多来自已知结构域的新组合,而不是大量全新 fold。
文献精读 Raygun:用蛋白语言模型实现模板蛋白的缩小、改造与扩增 2 分钟阅读 核心速递:Raygun 将可变长度蛋白序列编码为固定长度概率分布,使蛋白语言模型不仅能理解蛋白序列,还能在保留模板结构和功能线索的前提下进行可控的缩短、扩增和大规模序列编辑。
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