| 文献精读 | 水稻8大器官单细胞多组学全景图谱与功能基因发掘 |
核心速递 : 本研究首次利用单细胞多组学技术（同时解析 RNA 与 ATAC）构建了水稻8大核心器官的高精度细胞图谱，打破了以往单模态数据的局限，通过在硅计算机拟（in silico perturbation）与共表达网络分析，成功挖掘并验证了协同碳氮代谢与根系发育的关键农艺基因，为禾本科作物的发育时空轨迹...
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| 文献精读 | DeepSEED：结合专家知识与深度学习的启动子侧翼序列生成框架 |
核心速递 : 本研究提出了一种整合人类专家先验知识与深度生成模型（cGAN + DenseNet-LSTM）的 AI 框架 DeepSEED，突破性地证实了顺式调控元件周围的“侧翼序列”对启动子活性的决定性作用，并实现了跨物种的高性能合成启动子从头设计。 1. 论文基本信息 Title: Deep...
| 文献精读 | 蔗糖代谢与转运调控水稻茎-粒生物量分配以提高产量 |
核心速递 : > 本研究揭示了高产水稻通过下调茎秆结构性碳水化合物（如纤维素）投资、优化维管束韧皮部结构并上调蔗糖代谢与转运网络，系统性重塑“源-库-流”碳分配途径，从而最大化同化物向籽粒卸载的核心生理与分子机制。 1. 论文基本信息 Title: Sucrose metabolism an...
| 文献精读 | 连续空间转录组揭示玉米叶片发育的调控转换 |
核心速递 : 本研究深度优化了植物冷冻切片与 10x Visium 空间组学流程，首次高分辨率重构了玉米茎尖分生组织（SAM）至连续发育叶片的 3D 时空基因表达图谱，通过联合单细胞反褶积与时序网络，精准锚定了控制器官发生与细胞命运决定的转录因子级联模块。 1. 论文基本信息 Title: Ser...
| 文献精读 | BioCLIP：重塑生命之树分类范式的视觉基础大模型 |
核心速递 : 本文构建了迄今最大规模的生物图像数据集 TREEOFLIFE-10M，并提出了一种将生物学分类树（生命之树）层级结构“展平”融入多模态对比学习的视觉基础模型 BioCLIP，在未见物种的细粒度零样本分类上实现了革命性的性能飞跃。 1. 论文基本信息 Title: BioCLIP: A...
| 文献精读 | 单细胞多组学图谱解锁细胞奥秘：大豆与水稻的里程碑研究 |
核心速递 : 本文深入剖析了大豆与水稻的两项里程碑式单细胞多组学研究，展示了如何通过“转录组+染色质可及性+空间组学”的多模态整合，精准破译驱动复杂农艺性状与细胞命运转化的特异性基因调控网络（GRNs）。 1. 论文基本信息 Title: Single cell multi-omics atla...
| 文献精读 | 基于第一性原理的液态神经网络：下一代电信AI架构解析 |
核心速递 : 本研究系统性地阐述了基于仿生第一性原理的液态神经网络（LNNs）架构，通过连续时间常微分方程（ODE）建模与闭式解近似，成功打破了传统深度学习在动态环境下的鲁棒性、可解释性与计算复杂度瓶颈，为下一代高度动态的网络系统提供了全新的轻量级智能基座。 1. 论文基本信息 Title: Li...
| 文献精读 | 定义与基准测试单细胞分析中的开放问题 |
核心速递 : 本文提出了一个名为“Open Problems”的开源、动态更新的基准测试平台，旨在通过社区驱动的标准和自动化的云原生架构，解决单细胞领域算法评估中普遍存在的偏差和碎片化问题，为各类组学数据清洗与降维分析确立了真正的“最佳实践”。 1. 论文基本信息 Title: Defining...
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